可以将通用医院管理系统所必备的功能归纳如下，每个功能都包含若干个相关联子功能。
1.基础维护系统
“基础维护系统”用于维护药品信息、收费项目等
2.门诊管理系统
“门诊挂号”用于建立和维护病人的主索引信息，分配病人的ID号，确保病人信息的唯一性，为病人建立就诊卡，对门诊病人进行挂号或者预约号处理，为门诊病人的后继活动以及门诊工作量统计提供信息。
病人首次就医时可办理IC卡、磁卡等，实现一卡通看病，持卡病人就诊时通过刷卡代替频繁的排队交费，可以大大提高效率，减少病人的等待时间；挂号时计算机自动分配临时ID号，可选择输入病人姓名，挂号类别及就诊科室等信息，打印产生门诊挂号单，挂号单上的条码号将是病人各环节就医的依据，实现划价收费、项目检查、药房取药的一体化流水作业。
“门诊划价”用于完成门诊病人各种处方、检查申请、治疗申请等诊治费用的记价工作，各种药品、检查的价格信息在字典管理中维护。
“门诊收费”用于完成门诊病人各种诊治费用的收取工作，能依据划价单查询病人划价信息，进行费用收取、收据打印处理，并保存操作记录备查。
“药房发药”用于药房预先打印需要发货的药品明细，并将药品准备好，这样病人取药时就可以直接给病人，避免拿到病人的交费单后再去找相应的药品，提高工作效率。
3.院长综合查询系统
“院长综合查询”用于从医院信息系统中加工处理出有关医院管理的医、教、研和人、财、物等分析决策信息，以便为院长及各级管理者决策提供依据。

医生资料（编号，姓名，入职日期，科室编号，备注）
科室资料（编号，名称，备注）
药品资料（编号，名称，规格，入库单价，出库单价，批发价，整散比，分类，费用归类，拼音码，有效期，）
药品库存（编号，库房，药品编号，药品数量，备注）
病人信息库（编号，姓名，性别，年龄，民族，费用类型，电话，拼音码，）
门诊挂号（编号，病人编号，姓名，性别，挂号科室，费用类型，挂号类型，挂号费用，医生，时间，是否已划价）
门诊挂号类型（编号，挂号类型，挂号费）
门诊划价（编号，挂号编号，科室，医生，划价时间，划价员，是否收费，收费员，收费时间，划价金额，是否发药，发药时间，发药员）
门诊划价明细（编号, 划价编号, 药品编号, 单价, 数量, 金额）
门诊收费项目（编号，名称，拼音码，费用，费用分类，病种分类，备注）